jeudi 13 janvier 2011

Des défauts dans les cellules souches

Les cellules souches embryonnaires (CSE) et les cellules iPS (CiPS) sont atteintes des mêmes défauts que toutes les cellules en culture : elles accumulent des défauts chromosomiques avec l'âge. C'est un article de Cell Stem Cell qui vient de le démontrer. Un compte-rendu assez complet (à lire en fin de billet) a été fourni par APM International. À vrai dire cette nouvelle n'est pas franchement une surprise car toutes les cellules en culture sont victimes des mêmes défauts qui apparaissent peu à peu. Plus le temps de culture est long, plus les défauts sont nombreux.
Cela remet-il en cause les perspectives de thérapie cellulaire à partir des cellules souches ? Non pour deux raisons. La première est qu'on peut sélectionner des cellules non affectées, ou repartir d'un stock congelé rapidement après l'isolation des cellules souches ou leur reprogrammation. La deuxième raison est qu'on peut aussi décider d'utiliser des cellules souches aussi "fraîches" que possible. Et c'est là que cette étude devient intéressante.
Il est difficile d'imaginer que la recherche va pouvoir disposer d'un nombre illimité d'embryons à sacrifier pour la thérapie cellulaire ; et même si on pouvait en créer directement pour des fins de recherche, peu de femmes sont disposées à donner leurs ovules pour cela. Non, les seules cellules souches pluripotentes disponibles à volonté seront les CiPS et non les CSE... Ou encore mieux, on utilisera les CiD qui permettent de s'affranchir de l'étape cellule souche.




Le compte-rendu d'APM Internationa

Vendredi 7 janvier 2011 - 18:49
 
Des anomalies génétiques détectées dans les cellules souches pluripotentes
 
WASHINGTON, 7 janvier 2011 (AOPM) - Des anomalies génétiques ont été détectées dans les cellules souches pluripotentes, qu'elles soient d'origine embryonnaire ou obtenues par reprogrammation (les cellules iPS), avec en particulier dans les iPS des anomalies impliquant des gènes associés à la cancérogénèse, montrent des chercheurs de plusieurs pays dans la revue Cell Stem Cell.
Les cellules souches pluripotentes constituent un grand espoir pour la thérapie cellulaire de nombreuses maladies, grâce à la possibilité de faire différencier ces cellules en de nombreux types de cellules. Mais il est "prioritaire" de s'assurer que ces cellules n'ont pas de potentiel tumorigène.
Les aberrations génétiques étant fortement associées au risque de cancer, "il est important que les préparations cellulaires destinées à une utilisation clinique ne présentent pas d'altérations génomiques associées au cancer", commentent Louise Laurent de l'université de San Diego (Californie) et ses collègues.
D'autres équipes ont déjà montré que dans les cellules souches d'origine embryonnaire, des anomalies chromosomiques ont été détectées par caryotypage. Mais cette technique ne permet pas de détecter les petites anomalies génétiques; et pour les iPS, on manquait de données. C'est pourquoi ces chercheurs ont conduit une grande étude en utilisant la technique des SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) qui permet de détecter des mutations ponctuelles.
Ils ont étudié 186 échantillons de cellules pluripotentes (130 de cellules souches embryonnaires et 56 de cellules iPS), qu'ils ont comparés à 119 échantillons de cellules non pluripotentes.
Les chercheurs ont mis en évidence un grand nombre d'anomalies, dans les deux types de cellules souches, par rapport aux cellules non pluripotentes.
Les anomalies étaient différentes dans les deux types de cellules. Elles étaient plus nombreuses dans les iPS.
Et surtout, dans les iPS (cellules obtenues en induisant une dédifférenciation en cellules souches de cellules qui initialement sont différenciées), les chercheurs ont constaté que ce processus de reprogrammation était associé à des délétions de gènes suppresseurs de tumeurs. Puis les multiples passages en culture étaient associés à des duplications d'oncogènes.
Enfin, quand ces cellules étaient induites à différenciation, les chercheurs ont encore observé des duplications de gènes.
"Nous ne savons pas encore quels effets -s'il y en a- auront ces anomalies génétiques sur l'avenir des recherches et des applications cliniques [de ce type de cellules], mais nous devons le trouver", commente Jeanne Loring du Scripps Research Institute à La Jolla (Californie), qui a dirigé l'étude.
Les chercheurs ne considèrent pas, à ce stade, que cela remet en question l'intérêt des cellules souches pluripotentes, notamment les iPS. Mais ils concluent sur la nécessité de surveiller régulièrement au cours des multiples passages en culture l'intégrité du génome de ces cellules, et de tenter de trouver des méthodes de création de ces cellules et de culture qui préservent la stabilité génomique.
fb/ab/APM

mercredi 5 janvier 2011

Cellules CiD découverte de l'année 2010

Il est plus que temps de faire le bilan de l'année 2010. Et en ce qui concerne la thérapie cellulaire, le choix de la découverte de l'année est simple : il ne peut s'agir que des cellules induites différenciées (CiD), ces cellules différenciées directement transformées en autres cellules différenciées sans passer par la phase cellule souche. On ne fabrique donc plus nécessairement des cellules iPS (découverte de Yamanaka) qui ressemblent à des cellules souches embryonnaires (CSE) et ont donc le défaut majeur de risquer d'induire des tumeurs. Pour les CiD peu de risque de tumeur car ce ne sont pas des cellules souches.
Les premières CiD ont été découvertes en janvier 2010 : transformation de fibroblastes en neurones (Vierbuchen T et al. Nature. 2010. 463:1035-41, et compte-rendu ici sur le blog).
Puis en août 2010 : transformation de fibroblastes en cellules du muscle cardiaque (Ieda M et al. Cell. 2010. 142:375-86, compte-rendu ici).
Enfin en novembre 2010 : transformation de fibroblastes en cellules du sang (globules blancs, globules rouges ou plaquettes) avec essai clinique prévu dès 2012 (Szabo E et al. Nature. 2010. 468:521-526, avec le compte-rendu ).
Il s'agit donc d'un changement de paradigme majeur car il n’y a plus besoin de reprogrammer puis de redifférencier : on peut « transdifférencier » directement. Et comme un bon schéma vaut mieux qu'on long billet, en voici un (cliquer dessus pour l'avoir en grand format).

Maintenant essayez de trouver des articles en français sur ces découvertes (heureusement il y a PO Arduin à lire ici)... Et pourtant Nature comme Science les ont citées dans leurs rétrospectives 2010. Dire que pendant ce temps là en France on va autoriser la destruction d'embryons à des fins de recherche alors que le reste du monde a compris qu'il vaudrait mieux passer à autre chose !